Учебный курс ОДНКНР включает в себя 6 модулей: Основы православной культуры; Основы исламской культуры; Основы буддийской культуры; Основы иудейской культуры; Основы мировых религиозных культур; Основы светской этики.

Модули ОДНКНР отражают конкретное направление в программе ОДНКНР. Поскольку дисциплина имеет обязательный характер и отказаться от нее нельзя, родители вправе выбрать, какой из модулей будет изучать их ребенок. Правило устанавливает часть. 2 ст. 87 Федерального закона от 29.12.2012 № 273-ФЗ. Процедура выбора модуля аналогична процедуре выбора модулей по ОРКСЭ.